RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439600.2

LMO3-207, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2

Gene LMO3, Length 1,044 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-207ENST00000439600 Q6ZRG5 221 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 TMUB2Q71RG4 321 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 BPIFCQ8NFQ6 507 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 GINS3Q9BRX5 216 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 DKK2Q9UBU2 259 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 FBXL17Q9UF56 701 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 S4R3C0 116 aa8.33□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 K7EMT4 169 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 LGALS9O00182 355 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 AGPAT2O15120 278 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 BCL2L11O43521 198 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 YIF1AO95070 293 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 OR2C1O95371 312 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 CXCL2P19875 107 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 FGF7P21781 194 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 ELLP55199 621 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 DEFA5Q01523 94 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 TIGITQ495A1 244 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 PEMTQ9UBM1 199 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.32□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 A0A087WW49 117 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 ZNF320A2RRD8 509 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 PPP5D1E7EU14 171 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 BMPR1BO00238 502 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 IGKV1-17P01599 117 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 PSG1P11464 419 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 BMI1P35226 326 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 SERF2P84101 59 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 CD300CQ08708 224 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 IL17DQ8TAD2 202 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 C20orf173Q96LM9 149 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 C8orf49Q96NF6 230 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.31□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 A0A1W2PS18 150 aa8.3□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 MBP02144 154 aa8.3□□□□□ -1.08
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LMO3-207ENST00000439600 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.3□□□□□ -1.08
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LMO3-207ENST00000439600 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.3□□□□□ -1.08
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LMO3-207ENST00000439600 IL4P05112 153 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 CD5P06127 495 aa8.29□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 PLP1P60201 277 aa8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-207ENST00000439600 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-207ENST00000439600 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.29□□□□□ -1.08
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LMO3-207ENST00000439600 OVOL1O14753 267 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 SEC11BP0C7V7 166 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 LINC00869P0C866 280 aa8.28□□□□□ -1.08
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LMO3-207ENST00000439600 B2MP61769 119 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 DEFB136Q30KP8 78 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 RNF125Q96EQ8 232 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.28□□□□□ -1.08
LMO3-207ENST00000439600 C20orf24Q9BUV8 137 aa8.28□□□□□ -1.08
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