RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 MARVELD1Q9BSK0 173 aa7.88□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SOCS3O14543 225 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SPRY2O43597 315 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 ORM2P19652 201 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 PSMG4Q5JS54 123 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZWC4 215 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 RNF183Q96D59 192 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 CSTL1Q9H114 145 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A32Q9H2D1 315 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 NRN1Q9NPD7 142 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 DOK5Q9P104 306 aa7.87□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 IGSF23A1L1A6 192 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF98A6NK75 572 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 H0YIZ8 118 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 L7N2F9 121 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2CO00762 179 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 GOSR2O14653 212 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 DEDDO75618 318 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 CST7O76096 145 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 FABP1P07148 127 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 LYL1P12980 280 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 C4BPBP20851 252 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 S100A10P60903 97 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 VAMP2P63027 116 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 PATE2Q6UY27 113 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 BPIFCQ8NFQ6 507 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 MGST2Q99735 147 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.86□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0J9YWU9 116 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 FNDC10F2Z333 226 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 CFDP00746 253 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 CA1P00915 261 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 BCAP31P51572 246 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 CAV2P51636 162 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 GDF5OSQ5U4N7 250 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 STHQ8IWL8 128 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM217Q8N7C4 229 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 PPP1R14BQ96C90 147 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf173Q96LM9 149 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A22Q9H936 323 aa7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TENM2Q9NT68 2774 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 H3BRN7 92 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 PRAF2O60831 178 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00869P0C866 280 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 H2BFSP57053 126 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 PLP1P60201 277 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TEPPQ6URK8 271 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 UHRF2Q96PU4 802 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM147Q9BVK8 224 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 GGACTQ9BVM4 153 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 OR5AC2Q9NZP5 309 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.84□□□□□ -1.15
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 H3BMM0 161 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 AGPAT2O15120 278 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 HYPMO75409 117 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SULT1A1P50225 295 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 DEFA1P59665 94 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 DEFA3P59666 94 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 VWC2Q2TAL6 325 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 MORN5Q5VZ52 161 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00052Q96N35 136 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RSG1Q9BU20 258 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 NMES1Q9C002 83 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 ARL6Q9H0F7 186 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 CLEC5AQ9NY25 188 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 FBXL17Q9UF56 701 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 RYR2Q92736 4967 aa7.83□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 F6UB75 175 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 OR5G3P0C626 314 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 SELENOTP62341 195 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 NHLH2Q02577 135 aa7.82□□□□□ -1.16
ATG4B-210ENST00000428861 MIC13Q5XKP0 118 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.4 ms