RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 ORMDL2Q53FV1 153 aa11.95□□□□□ -0.5
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PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.95□□□□□ -0.5
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PTPRU-204ENST00000428026 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.89□□□□□ -0.51
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PTPRU-204ENST00000428026 LINC00479Q96M42 142 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 RPRMLQ8N4K4 120 aa11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PTPRU-204ENST00000428026 ROS1P08922 2347 aa11.88□□□□□ -0.51
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