RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMAIP1Q13794 54 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C8orf74Q6P047 294 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 Q8IYB0 196 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR5AS1Q8N127 324 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR52A5Q9H2C5 316 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51I1Q9H343 314 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TREM1Q9NP99 234 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 LY96Q9Y6Y9 160 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 HSPG2P98160 4391 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUP155O75694 1391 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 E7EUB6 86 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CYB5BO43169 146 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERPINE1P05121 402 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBP1P09455 135 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SERPINB9P50453 376 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 DEFA1P59665 94 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 VBP1P61758 197 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPL37P61927 97 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDK6Q00534 326 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRN1Q6UXK5 716 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C20orf196Q8IYI0 205 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR10AG1Q8NH19 301 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIGXQ8TBF5 258 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 WFDC5Q8TCV5 224 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM172AQ8WUF8 416 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 GGACTQ9BVM4 153 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC90BQ9GZT6 254 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 DRC3Q9H069 523 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FBXO5Q9UKT4 447 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCN8AQ9UQD0 1980 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERICH2A1L162 156 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 GOLGA8KD6RF30 607 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0QZ92 97 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0R233 179 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CXCR6O00574 342 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS12P25398 132 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPL5P46777 297 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB5BP61020 215 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 HECW2Q9P2P5 1572 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 NEO1Q92859 1461 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 A8MWV9 139 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 J3QRK9 145 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 YKT6O15498 198 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNNC2P02585 160 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR5G3P0C626 314 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C8orf88P0DMB2 117 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD79AP11912 226 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RPS20P60866 119 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PSME3P61289 254 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PATE2Q6UY27 113 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51A2Q8NGJ7 313 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR10K1Q8NGX5 313 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB37Q96AX2 223 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAD50Q92878 1312 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 COL24A1Q17RW2 1714 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 UNC13BO14795 1591 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 MIA2Q96PC5 1412 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A096LPI6 279 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C17orf112F2Z3M2 114 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFB3O43676 98 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 COX5BP10606 129 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 TCL1AP56279 114 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 AP3S2P59780 193 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ROMO1P60602 79 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYL5Q02045 173 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SFXN4Q6P4A7 337 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDZD9Q8IXQ8 264 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 C10orf111Q8N326 155 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAB8BQ92930 207 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC35B4Q969S0 331 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR52E6Q96RD3 313 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIMD2Q9BT23 127 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 PKIGQ9Y2B9 76 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 FABP12A6NFH5 140 aa-0.71□□□□□ -2.52
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms