RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380958.7

PAN3-201, Transcript of poly(A) specific ribonuclease subunit PAN3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PAN3, Length 2,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3-201ENST00000380958 ZZEF1O43149 2961 aa16.02■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 MC5RP33032 325 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 RBPJQ06330 500 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PAXXQ9BUH6 204 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 IZUMO1RA6ND01 250 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TAX1BP3O14907 124 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 MOSP00540 346 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 SCGB2A2Q13296 93 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 SPACA3Q8IXA5 215 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 NUP35Q8NFH5 326 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.01■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PRRX1P54821 245 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 CCL17Q92583 94 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 M0R2Z0 102 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 FCN3O75636 299 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TOX4O94842 621 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 NBL1P41271 181 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 COX19Q49B96 90 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 OR1L4Q8NGR5 311 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PSMB11A5LHX3 300 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 VMA21Q3ZAQ7 101 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 C10orf113Q5VZT2 155 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TCF24Q7RTU0 167 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 KIR3DL3Q8N743 410 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PRSS33Q8NF86 280 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 SSUH2Q9Y2M2 353 aa16■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 HIGD1CA8MV81 97 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 WT1-ASQ06250 92 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 MPV17L2Q567V2 206 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 HCP5Q6MZN7 132 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 Q8NA96 180 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 STXBP6Q8NFX7 210 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 ACACAQ13085 2346 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 DLX6P56179 175 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TMEM155Q4W5P6 130 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PATE2Q6UY27 113 aa15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PEX7O00628 323 aa15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PPIAL4GP0DN37 164 aa15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 LOXP28300 417 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 DLX1P56177 255 aa15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 ARF6P62330 175 aa15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 DYNLRB1Q9NP97 96 aa15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 IGLV2-23P01705 113 aa15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.98■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PAX2Q02962 417 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TBR1Q16650 682 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 EBLN2Q6P2I7 272 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 ZNF329Q86UD4 541 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 THAP8Q8NA92 274 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 CTSZQ9UBR2 303 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 VWC2LB2RUY7 222 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 PSG9Q00887 426 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 LYPD2Q6UXB3 125 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 ZNF841Q6ZN19 808 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 LINC00305Q7Z4B0 112 aa15.97■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 CEACAM3P40198 252 aa15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 H0Y8G0 127 aa15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 ENSAO43768 121 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 UBE2G1P62253 170 aa15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 RITA1Q96K30 269 aa15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PAN3-201ENST00000380958 AKAP13Q12802 2813 aa15.96■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 CGB1A6NKQ9 187 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 SHISA9B4DS77 424 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 IGHV1-8P0DP01 117 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 SVEP1Q4LDE5 3571 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 PGPA6NDG6 321 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 SLC25A17O43808 307 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 SMAGPQ0VAQ4 97 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 FAM181BA6NEQ2 426 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 G3V4G9 280 aa15.95■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 RELNP78509 3460 aa15.94■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.94■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa15.94■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 SPATA12Q7Z6I5 190 aa15.94■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 MUC15Q8N387 334 aa15.94■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 TEX45Q8NA69 505 aa15.94■□□□□ 0.14
PAN3-201ENST00000380958 OR8B2Q96RD0 313 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms