RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BTG2P78543 158 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HFEQ30201 348 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C9orf153Q5TBE3 101 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUDCD3Q8IVD9 361 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 Q8N8P6 123 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR13D1Q8NGV5 346 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CLHC1Q8NHS4 586 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR51E1Q8TCB6 317 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ORAOV1Q8WV07 137 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM213AQ9BRX8 229 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC22A4Q9H015 551 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM153AQ9UHL3 310 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POFUT2Q9Y2G5 429 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UFC1Q9Y3C8 167 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa-3.25□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 XKRY2A2RUG3 117 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRAPPC6AO75865 159 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR7A10O76100 309 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DIRAS3O95661 229 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSPAN12O95859 305 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TCL1BO95988 128 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5AL1P0C617 328 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ORM2P19652 201 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM33P57088 247 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FLOT2Q14254 428 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GABRA6Q16445 453 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRBOX4Q5JUW0 171 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MFSD4BQ5TF39 518 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERASQ7Z444 233 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM86BQ8N661 226 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPC24Q8NBT2 197 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR56B1Q8NGI3 324 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5K1Q8NHB7 308 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC00208Q96KT6 92 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM237Q96Q45 408 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSKH2Q96QS6 385 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 METTL9Q9H1A3 318 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR51I2Q9H344 312 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CMTM6Q9NX76 183 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC39A1Q9NY26 324 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IL36GQ9NZH8 169 aa-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-3.26□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 A0A0A6YYD5 115 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC69A6NI79 296 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDC42EP2O14613 210 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF13O43567 381 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GGPS1O95749 300 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRBV12-3P01733 135 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GYPCP04921 128 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 UBBP0CG47 229 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OGNP20774 298 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NPPCP23582 126 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNAP25P60880 206 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CXCR4P61073 352 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RPS24P62847 133 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CARTPTQ16568 116 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DGUOKQ16854 277 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CTSL3PQ5NE16 218 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HBMQ6B0K9 141 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DHFR2Q86XF0 187 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C1orf174Q8IYL3 243 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OFCC1Q8IZS5 231 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR5AS1Q8N127 324 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMEM230Q96A57 120 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCDC127Q96BQ5 260 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TBC1D31Q96DN5 1066 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 REEP6Q96HR9 211 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CABS1Q96KC9 395 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KCTD7Q96MP8 289 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FAM210AQ96ND0 272 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC38A2Q96QD8 506 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FTHL17Q9BXU8 183 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSTPIP2Q9H939 334 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BATF3Q9NR55 127 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HEBP1Q9NRV9 189 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RABAC1Q9UI14 185 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LINC00527Q9UJ94 153 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANAPC10Q9UM13 185 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EPDR1Q9UM22 224 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC22A14Q9Y267 594 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-3.27□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 OR4C45A6NMZ5 311 aa-3.28□□□□□ -2.93
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP-3.28□□□□□ -2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms