RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TOMM40O96008 361 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-17P01599 117 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 NPPCP23582 126 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 S100A11P31949 105 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TFPI2P48307 235 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SULT1A1P50225 295 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PAFAH1B2P68402 229 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 GAMTQ14353 236 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1FQ16864 119 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TCF24Q7RTU0 167 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 APRG1Q8IVJ8 170 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM170AQ8WVE7 144 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPB3Q92617 1050 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TRGV9Q99603 122 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 VSIRQ9H7M9 311 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ALG5Q9Y673 324 aa5.68□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SMCO3A2RU48 225 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 HELTA6NFD8 242 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 DFFBO76075 338 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY1P47900 373 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IL15RAQ13261 267 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RAB32Q13637 225 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF124Q15973 351 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MLANAQ16655 118 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB135Q30KP9 77 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TIGITQ495A1 244 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TEPPQ6URK8 271 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZWC4 215 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 STPG3Q8N7X2 389 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 THAP8Q8NA92 274 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IL17DQ8TAD2 202 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RABAC1Q9UI14 185 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.67□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS46E5RG02 174 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 UBE2CO00762 179 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SPRY2O43597 315 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MPDU1O75352 247 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 IL4P05112 153 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 CRYBB3P26998 211 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PAX9P55771 341 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 H2BFSP57053 126 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RAP2BP61225 183 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF546Q86UE3 836 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 THAP6Q8TBB0 222 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 CHAC2Q8WUX2 184 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RNF125Q96EQ8 232 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 UQCC1Q9NVA1 299 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL17Q9UF56 701 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.66□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 LCE6AA0A183 80 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 SIX6O95475 246 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 MPC2O95563 127 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PSG1P11464 419 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf194Q5T5A4 169 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 FAM24BQ8N5W8 94 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R14BQ96C90 147 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 RNF183Q96D59 192 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 GPR82Q96P67 336 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.65□□□□□ -1.5
SGMS1-201ENST00000361543 AGRNO00468 2067 aa5.65□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0J9YWU9 116 aa5.64□□□□□ -1.51
SGMS1-201ENST00000361543 PMS2P5A8MQ11 134 aa5.64□□□□□ -1.51
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