RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 NUDT3O95989 172 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 RAB31Q13636 194 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 OR4A16Q8NH70 328 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 FBN2P35556 2912 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 NPY1RP25929 384 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PSG5Q15238 335 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 TIMD4Q96H15 378 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 CENPEQ02224 2701 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 OR4C46A6NHA9 309 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 C22orf46C9J442 243 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PRR20EP86478 221 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PRR20CP86479 221 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PRR20DP86480 221 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PRR20BP86481 221 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 PRR20AP86496 221 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 SPG11Q96JI7 2443 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX11-201ENST00000359238 A1L4Q6 167 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 OR2J3O76001 311 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 TMEM11P17152 192 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 GAGE12BA1L429 117 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 CD5LO43866 347 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 CIDEAO60543 219 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 MUC21Q5SSG8 566 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 RITA1Q96K30 269 aa14.89□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 OR4S2Q8NH73 311 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 FSTL3O95633 263 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 S100A7P31151 101 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 PSG9Q00887 426 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 MBD6Q96DN6 1003 aa14.88□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 TP73-AS1Q9UF72 201 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 GGTLC3B5MD39 225 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 HLA-DRB1P01911 266 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 MFAP2P55001 183 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 RPL8P62917 257 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 FAM168AQ92567 244 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.87□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 ACTL6BO94805 426 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 EFNA4P52798 201 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 ZNF503Q96F45 646 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 RTL8BQ17RB0 113 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 TCF19Q9Y242 345 aa14.86□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 A0A1W2PRE2 83 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 CORTO00230 105 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 PET117Q6UWS5 81 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 TMEM133Q9H2Q1 129 aa14.85□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 E7EUB6 86 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 FNDC10F2Z333 226 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 COX7A1P24310 79 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 ERVK-16P61578 105 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 NUP35Q8NFH5 326 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 NABP2Q9BQ15 211 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 hDV102S1A0JD36 115 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 OVOL3O00110 214 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 IGLC1P0CG04 106 aa14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SNX11-201ENST00000359238 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms