RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 ATP6V0E1O15342 81 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 PAGE4O60829 102 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 GZMBP10144 247 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 SLC25A16P16260 332 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 RIPPLY3P57055 190 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.66□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF320A2RRD8 509 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGPS1-201ENST00000282841 BLCAPP62952 87 aa8.65□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.65□□□□□ -1.02
GGPS1-201ENST00000282841 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGPS1-201ENST00000282841 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 H3BTX0 84 aa8.65□□□□□ -1.03
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GGPS1-201ENST00000282841 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.65□□□□□ -1.03
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GGPS1-201ENST00000282841 PRR20CP86479 221 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PRR20DP86480 221 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PRR20BP86481 221 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PRR20AP86496 221 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 RAB31Q13636 194 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR1P1Q8NH06 330 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 RNF5Q99942 180 aa8.65□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 M0R036 132 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 AMY1AP04745 511 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 DSCR9P59020 149 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 CST9LP1Q5W188 147 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 MPDU1O75352 247 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 IGHV4-59P01825 116 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 MAS1LP35410 378 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ERVFC1-1P60608 527 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 EBI3Q14213 229 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 TIGITQ495A1 244 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR4X1Q8NH49 305 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 SLC35B3Q9H1N7 401 aa8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OOSP1A8MZH6 123 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 K7EIM0 57 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 BCL2P10415 239 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ATP5G3P48201 142 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 AWAT1Q58HT5 328 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.63□□□□□ -1.03
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GGPS1-201ENST00000282841 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 I3L2K1 104 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFB8O95169 186 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HBE1P02100 147 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PATE2Q6UY27 113 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR4F5Q8NH21 305 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR4F4Q96R69 305 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR7C2O60412 319 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 CLEC3BP05452 202 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PYYP10082 97 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 SOHLH1Q5JUK2 328 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.63□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.63□□□□□ -1.03
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GGPS1-201ENST00000282841 F6UZH7 168 aa8.62□□□□□ -1.03
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GGPS1-201ENST00000282841 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 OR2T8A6NH00 312 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 TEX38Q6PEX7 206 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 C1QL4Q86Z23 238 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 DERL1Q9BUN8 251 aa8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BKO60814 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BJP06899 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 PSG1P11464 419 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BOP23527 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BBP33778 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BDP58876 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 LYZP61626 148 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST1H2BCP62807 126 aa8.61□□□□□ -1.03
GGPS1-201ENST00000282841 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.61□□□□□ -1.03
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