RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 EVI2AP22794 236 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 CNTFRP26992 372 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 IGHG3P01860 377 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PAX9P55771 341 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PRSS8Q16651 343 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 DTX1Q86Y01 620 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 GAFA1Q96PS6 74 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TANC2Q9HCD6 1990 aa4.51□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 NCR2O95944 276 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 C15orf32Q32M92 178 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 REC114Q7Z4M0 266 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 HIST1H4GQ99525 98 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 BPESC1Q9GZL8 116 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TUBA4BQ9H853 241 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PSG8Q9UQ74 426 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 A0A087WWC5 75 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 GAGE10A6NGK3 116 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TNFSF13O75888 250 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 AMBPP02760 352 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ZNF134P52741 427 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 HERVK_113P61574 105 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PSG9Q00887 426 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TMEM30BQ3MIR4 351 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PYY3Q5JQD4 70 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PRE2 83 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 A6NDN8 102 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 M0QZK8 103 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 CEACAM4O75871 244 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ASCL4Q6XD76 172 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 NUDT11Q96G61 164 aa4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 H0YJW9 148 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TAS2R60P59551 318 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FAM90A2PQ658T7 463 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 C19orf67A6NJJ6 358 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 H3BUX3 64 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SPRNQ5BIV9 151 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FOXC2Q99958 501 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PRDM13Q9H4Q3 707 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SIGLEC9Q9Y336 463 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 A0A0U1RRA0 63 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PPI3 338 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ZNF688P0C7X2 276 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 PLA2G5P39877 138 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 RRN3P1Q2M238 152 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 DNLZQ5SXM8 178 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 JMJD8Q96S16 334 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 ACANP16112 2415 aa4.49□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FABP5P3A8MUU1 101 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 CIDEAO60543 219 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 CD7P09564 240 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FOXL1Q12952 345 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 NDUFA3O95167 84 aa4.48□□□□□ -1.69
LMO3-201ENST00000261169 HTN3P15516 51 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms