RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 MAP6D1Q9H9H5 199 aa16.51■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 STAB2Q8WWQ8 2551 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 HELTA6NFD8 242 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 E5RGE8 158 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 MPC2O95563 127 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 NHLH2Q02577 135 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 RGS21Q2M5E4 152 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 STXBP6Q8NFX7 210 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 OR11H7Q8NGC8 314 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 MGST2Q99735 147 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 SLC45A2Q9UMX9 530 aa16.5■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 RLN2P04090 185 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 ORM2P19652 201 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 S100A11P31949 105 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 SELENOTP62341 195 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 FCN2Q15485 313 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 C1orf194Q5T5A4 169 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 PATE2Q6UY27 113 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 C17orf77Q96MU5 243 aa16.49■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 AGPAT2O15120 278 aa16.48■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 WDR83OSQ9Y284 106 aa16.48■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 U3KQK5 164 aa16.48■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 ZNF98A6NK75 572 aa16.47■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 LINC00869P0C866 280 aa16.47■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 STX12Q86Y82 276 aa16.47■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 OR1B1Q8NGR6 318 aa16.47■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 UQCC1Q9NVA1 299 aa16.47■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 DEFB131AP59861 70 aa16.46■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 TMEM147Q9BVK8 224 aa16.46■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 DOK5Q9P104 306 aa16.46■□□□□ 0.23
SYF2-201ENST00000236273 AGRNO00468 2067 aa16.46■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 LYL1P12980 280 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 HBG1P69891 147 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 HBG2P69892 147 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1FQ16864 119 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 RCHY1Q96PM5 261 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 GGTLC1Q9BX51 225 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 MED28Q9H204 178 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 NRN1Q9NPD7 142 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PFDN2Q9UHV9 154 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 H3BRN7 92 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 HYPMO75409 117 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 LEMD1Q68G75 181 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 ZNF546Q86UE3 836 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 CHAC2Q8WUX2 184 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A31Q9H0C2 315 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A32Q9H2D1 315 aa16.45■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SOCS3O14543 225 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 ZNF688P0C7X2 276 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 CAMLGP49069 296 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PRR20EP86478 221 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PRR20CP86479 221 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PRR20DP86480 221 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PRR20BP86481 221 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PRR20AP86496 221 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 OR8I2Q8N0Y5 310 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 OR5C1Q8NGR4 320 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 TMEM37Q8WXS4 190 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R14BQ96C90 147 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 UHRF2Q96PU4 802 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SPATA25Q9BR10 227 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SCRT1Q9BWW7 348 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 ARL6Q9H0F7 186 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 ZMAT4Q9H898 229 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 RETNQ9HD89 108 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 MBD2Q9UBB5 411 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 FBXL17Q9UF56 701 aa16.44■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa16.43■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 BAXQ07812 192 aa16.43■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 MIC13Q5XKP0 118 aa16.43■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 HIGD1AQ9Y241 93 aa16.43■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 Q5BKY6 102 aa16.42■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 ARV1Q9H2C2 271 aa16.42■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A22Q9H936 323 aa16.42■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 OR5G3P0C626 314 aa16.41■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 RPL29P47914 159 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 OPCMLQ14982 345 aa16.41■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PXDC1Q5TGL8 231 aa16.41■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 PET100P0DJ07 73 aa16.4■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 RAP2BP61225 183 aa16.4■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 MORN5Q5VZ52 161 aa16.4■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 HSPB11Q9Y547 144 aa16.4■□□□□ 0.22
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 FGF7P21781 194 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 RPL12P30050 165 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 RAB31Q13636 194 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-201ENST00000236273 CLINT1Q14677 625 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms