RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 ZFP92A6NM28 416 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 CTDSP2O14595 271 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 HTN3P15516 51 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 CCR6P51684 374 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 COQ8AQ8NI60 647 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 SMIM4Q8WVI0 70 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 C20orf173Q96LM9 149 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 C17orf77Q96MU5 243 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.13□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 A0A0B4J2A0 478 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 AKAIN1P0CW23 69 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 SMCO1Q147U7 214 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 RRN3P1Q2M238 152 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 AMTNQ6UX39 209 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.12□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 CTDSPLO15194 276 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 LYZP61626 148 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 OR2F1Q13607 317 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 OR8I2Q8N0Y5 310 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 TRGV9Q99603 122 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 PRRT1Q99946 306 aa11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 DAD1P61803 113 aa11.1□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 SLC35E1Q96K37 410 aa11.1□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.1□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.1□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 RPRMQ9NS64 109 aa11.1□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 DOK5Q9P104 306 aa11.1□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 RGS5O15539 181 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 PITX3O75364 302 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 PRM2P04554 102 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 FABP1P07148 127 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 TNP2Q05952 138 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 THAP8Q8NA92 274 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 C15orf53Q8NAA6 179 aa11.09□□□□□ -0.63
NME3-201ENST00000219302 CRXO43186 299 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SMIM18P0DKX4 95 aa11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 ALDH3B2P48448 385 aa11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 MEOX2P50222 304 aa11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 C16orf92Q96LL3 132 aa11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 RSG1Q9BU20 258 aa11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SLC25A32Q9H2D1 315 aa11.08□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 ZNF98A6NK75 572 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 AKR1C4P17516 323 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 OR1S1Q8NH92 325 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.07□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 LYRM9A8MSI8 78 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 PRSS46E5RG02 174 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 CDK2AP2O75956 126 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 GALR1P47211 349 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 CNN1P51911 297 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SPCS2Q15005 226 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.06□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 C16orf90A8MZG2 172 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 TSPOP30536 169 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 RAB11AP62491 216 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SRPXP78539 464 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 IL18Q14116 193 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SLC25A22Q9H936 323 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.05□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 M0R2Z0 102 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 IAPPP10997 89 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 ANXA3P12429 323 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 AZU1P20160 251 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 FCN2Q15485 313 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 IGFL4Q6B9Z1 124 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 C6orf223Q8N319 242 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 OR1B1Q8NGR6 318 aa11.04□□□□□ -0.64
NME3-201ENST00000219302 SOSTQ9BQB4 213 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms