RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFB3	O43676	98 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1D-12	P01611	117 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PSG2	P11465	335 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PMCH	P20382	165 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	F2R	P25116	425 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FUT6	P51993	359 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4A5	Q8NH83	315 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PP6455	Q8WZ26	134 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CITED1	Q99966	193 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	GNB4	Q9HAV0	340 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CNIH1	O95406	144 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PRDX2	P32119	198 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	KLRD1	Q13241	179 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52E5	Q8NH55	327 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	DYSF	O75923	2080 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		J3QT63	122 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ADH4	P08319	380 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF726P1	Q15940	193 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF585B	Q52M93	769 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ATOH7	Q8N100	152 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MBD6	Q96DN6	1003 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IL36G	Q9NZH8	169 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	C1RL	Q9NZP8	487 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FCN1	O00602	326 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	DEGS1	O15121	323 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SIVA1	O15304	175 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ISG15	P05161	165 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MSMB	P08118	114 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CBLN1	P23435	193 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CRYBB3	P26998	211 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	MZT1	Q08AG7	82 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ARFRP1	Q13795	201 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LHX4	Q969G2	390 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		F2Z2F3	143 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PSPN	O60542	156 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	AVP	P01185	164 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A16	P16260	332 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CD24	P25063	80 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495		B4DSR2	109 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF12	P61328	243 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	LMO4	P61968	165 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2G1	P62253	170 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	CD177	Q8N6Q3	437 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	PECR	Q9BY49	303 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2H2	O95918	312 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		5.86	□□□□□ -1.47

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