RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607714.5

TIMM50-220, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM50, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-220ENST00000607714 GAMTQ14353 236 aa11.93□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 TRIQKQ629K1 86 aa11.93□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.93□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.93□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 CENPXA8MT69 81 aa11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 IL4P05112 153 aa11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 HOXB5P09067 269 aa11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 PSG1P11464 419 aa11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 PFDN2Q9UHV9 154 aa11.92□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 C9orf170A2RU37 121 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 ZFP92A6NM28 416 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 NDUFB6O95139 128 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 LEMD1Q68G75 181 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 OR51G1Q8NGK1 321 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 OR11H2Q8NH07 326 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 SLC35E1Q96K37 410 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 FBXL17Q9UF56 701 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.91□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 BUB3O43684 328 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 SYNGR2O43760 224 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 FABP1P07148 127 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 IAPPP10997 89 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 DHRS2Q13268 280 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 STHQ8IWL8 128 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 DCANP1Q8TF63 244 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 GLMPQ8WWB7 406 aa11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TIMM50-220ENST00000607714 AGRNO00468 2067 aa11.9□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 DEFB4AO15263 64 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 KMT2AQ03164 3969 aa11.89□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 WRBO00258 174 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 CA1P00915 261 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 IFNA21P01568 189 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF688P0C7X2 276 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 ID3Q02535 119 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 ZNF90Q03938 601 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 COQ8AQ8NI60 647 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 RNF125Q96EQ8 232 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.88□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 OR4E1P0C645 316 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 RAB40CQ96S21 281 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 TRGV9Q99603 122 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 MFFQ9GZY8 342 aa11.87□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 ADAP1O75689 374 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 IL7P13232 177 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 C4orf46Q504U0 113 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 NRN1Q9NPD7 142 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 KNCNA6PVL3 124 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PSMG4Q5JS54 123 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 THAP8Q8NA92 274 aa11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SPP1P10451 314 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 OR2F1Q13607 317 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 C2CD4CQ8TF44 421 aa11.85□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PLA2G10O15496 165 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 BTCP35070 178 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 LYZP61626 148 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PRR20EP86478 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PRR20CP86479 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PRR20DP86480 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PRR20BP86481 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PRR20AP86496 221 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 SMIM8Q96KF7 97 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PSENENQ9NZ42 101 aa11.84□□□□□ -0.51
TIMM50-220ENST00000607714 PRSS46E5RG02 174 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms