RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2BCP62807 126 aa20.24■□□□□ 0.83
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CAPNS1-204ENST00000587718 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 NECAP1Q8NC96 275 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5AU1Q8NGC0 362 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 PAXXQ9BUH6 204 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 C7orf69Q9H7B7 122 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMM23O14925 209 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-204ENST00000587718 MOSP00540 346 aa20.12■□□□□ 0.81
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