RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM217Q8N7C4 229 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR51G1Q8NGK1 321 aa22.23■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 NAP1L6A6NFF2 107 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 MED6O75586 246 aa22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 BUB3O43684 328 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 GGNBP1Q5YKI7 109 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 RNF125Q96EQ8 232 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 PBDC1Q9BVG4 233 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 MAGT1Q9H0U3 335 aa22.21■■□□□ 1.15
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 NDUFB6O95139 128 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF90Q03938 601 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR11H2Q8NH07 326 aa22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 C9orf170A2RU37 121 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 NUPR2A6NF83 97 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 KNCNA6PVL3 124 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 SYNGR2O43760 224 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 WRBO00258 174 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 FLVCR2Q9UPI3 526 aa22.18■■□□□ 1.14
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PSMG4Q5JS54 123 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 NRN1Q9NPD7 142 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 ADAP1O75689 374 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 FABP1P07148 127 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 ACTL10Q5JWF8 245 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR8G2PQ6IF36 304 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 AGRNO00468 2067 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 LYZP61626 148 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 PFDN2Q9UHV9 154 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 DNAH1Q9P2D7 4330 aa22.14■■□□□ 1.14
CTDNEP1-206ENST00000571409 CENPXA8MT69 81 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 SPP1P10451 314 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR2F1Q13607 317 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRGV9Q99603 122 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR4E1P0C645 316 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 IL7P13232 177 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 BTCP35070 178 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 SPANXN5Q5MJ07 72 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 COQ8AQ8NI60 647 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAB40CQ96S21 281 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa22.12■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PRSS46E5RG02 174 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 H3BP45 60 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 C4BPBP20851 252 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM41BQ5BJD5 291 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 THAP8Q8NA92 274 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 HYDINQ4G0P3 5121 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEFB4AO15263 64 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-206ENST00000571409 C4orf46Q504U0 113 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 IFNA21P01568 189 aa22.09■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-206ENST00000571409 C11orf45Q8TAV5 145 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPP1R14BQ96C90 147 aa22.08■■□□□ 1.13
CTDNEP1-206ENST00000571409 FBXL17Q9UF56 701 aa22.08■■□□□ 1.13
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CTDNEP1-206ENST00000571409 C1orf194Q5T5A4 169 aa22.07■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 Q8NAQ8 132 aa22.06■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CLEC5AQ9NY25 188 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 CFDP00746 253 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 AKR1C1Q04828 323 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 PSENENQ9NZ42 101 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 SSSCA1O60232 199 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 LY6G6CO95867 125 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 H3BMM0 161 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 CNPY1Q3B7I2 92 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR8I2Q8N0Y5 310 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-206ENST00000571409 PLA2G10O15496 165 aa22.02■■□□□ 1.12
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