RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566200.1

ABCA3-204, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 3, human

TSL 3

Gene ABCA3, Length 1,232 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA3-204	ENST00000566200	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	AKAIN1	P0CW23	69 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	SPCS2	Q15005	226 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	CTDSPL	O15194	276 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	IL22RA2	Q969J5	263 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	RNF125	Q96EQ8	232 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	PKD1	P98161	4303 aa		13.47	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	IFNA10	P01566	189 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	NEU1	Q99519	415 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	PRRT1	Q99946	306 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	RBKS	Q9H477	322 aa		13.46	□□□□□ -0.25
ABCA3-204	ENST00000566200	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SOCS3	O14543	225 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	FXYD7	P58549	80 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	ZNF90	Q03938	601 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	NOXA1	Q86UR1	476 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	DTD1	Q8TEA8	209 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200		U3KQ87	197 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	RTL8C	O15255	209 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	ALDH3B2	P48448	385 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	CCR6	P51684	374 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	IL18	Q14116	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	GAMT	Q14353	236 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SMCO1	Q147U7	214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	LGI3	Q8N145	548 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	ZNF709	Q8N972	641 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200		A0A0B4J2A0	478 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200		P0DMU3	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	EMP1	P54849	157 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	LINC00052	Q96N35	136 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	ZFP92	A6NM28	416 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200		M0R2N4	97 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	AKR1C4	P17516	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	PSMB3	P49720	205 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	ZNF79	Q15937	498 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200		F6UB75	175 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ABCA3-204	ENST00000566200	TMEM189	A5PLL7	270 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	PITX3	O75364	302 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	LYZ	P61626	148 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	OR2F1	Q13607	317 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	C17orf77	Q96MU5	243 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	SOST	Q9BQB4	213 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ABCA3-204	ENST00000566200	ID1	P41134	155 aa		13.38	□□□□□ -0.27

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