RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 MND1Q9BWT6 205 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE12BA1L429 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM235A6NFC5 223 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF98A6NK75 572 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 K7EP13 123 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ISLRO14498 428 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PDCD5O14737 125 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE7O76087 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 IGKV1-17P01599 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE12FP0CL80 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE12GP0CL81 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GAGE12IP0CL82 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 S100GP29377 79 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TAS2R60P59551 318 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 DHODHQ02127 395 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 IDNKQ5T6J7 187 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 BAP18Q8IXM2 172 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 A0A096LPF7 62 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 SCGNO76038 276 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 OR10J1P30954 320 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TRAM1Q15629 374 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 Q8N814 137 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 NRG4Q8WWG1 115 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GPR146Q96CH1 333 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 C16orf92Q96LL3 132 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 SNURFLB1AK76 121 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GNAO1P09471 354 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 IGLC1P0CG04 106 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 RD3LP0DJH9 198 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PTHLHP12272 177 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 HOXA5P20719 270 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 UCP1P25874 307 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PSMB9P28065 219 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 ETV6P41212 452 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 MEOX2P50222 304 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 RND2P52198 227 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 GAMTQ14353 236 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 SPHARQ15513 63 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 PPP1R14BQ96C90 147 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 IFITM5A6NNB3 132 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SLC25A4P12235 298 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RHOBP62745 196 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 AMTNQ6UX39 209 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 Q6ZSA8 131 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 Q9H521 79 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 PTGES3LE9PB15 166 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 TOMM40O96008 361 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 HSMCR30P0CW71 290 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 MYL9P24844 172 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 AQP4P55087 323 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 MLANAQ16655 118 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SCXQ7RTU7 201 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RAB26Q9ULW5 256 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 A8MTW9 85 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 GPR31O00270 319 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SOCS3O14543 225 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 SSX5O60225 188 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 GAS8-AS1O95177 125 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 FCER2P06734 321 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ELK1P19419 428 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 HOGA1Q86XE5 327 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD3-211ENST00000559460 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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