RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.25□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 A8MWP6 167 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 WRBO00258 174 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 UPK1BO75841 260 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IFNA21P01568 189 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SLC25A6P12236 298 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 GYPEP15421 78 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 NPY1RP25929 384 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 RELQ04864 619 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 BTNL8Q6UX41 500 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 NUDT15Q9NV35 164 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 U3KQ87 197 aa7.24□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SYNGR2O43760 224 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 CLN5O75503 358 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 IFNA4P05014 189 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 C8orf88P0DMB2 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 RND2P52198 227 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ASAH1Q13510 395 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TIGITQ495A1 244 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 NOXA1Q86UR1 476 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 OR2K2Q8NGT1 345 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 OR4X1Q8NH49 305 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 OR10C1Q96KK4 312 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SORL1Q92673 2214 aa7.23□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 C15orf62A8K5M9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 FAM90A26D6RGX4 464 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 K7EMT4 169 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 CCSO14618 274 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MED6O75586 246 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 CD7P09564 240 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 STPG3Q8N7X2 389 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MITD1Q8WV92 249 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 NPIPB3Q92617 1050 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 MARC2Q969Z3 335 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 ACY3Q96HD9 319 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 SMPXQ9UHP9 88 aa7.22□□□□□ -1.25
CS-217ENST00000550044 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGKV1-17P01599 117 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SLC25A4P12235 298 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 CD81P60033 236 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-2P60368 255 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SPANXN5Q5MJ07 72 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ENKURQ8TC29 256 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 NEURL2Q9BR09 285 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.21□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 C5orf51A6NDU8 294 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 FAM25EA8MYX2 175 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 H3BP45 60 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 CHEK1O14757 476 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 IGLC1P0CG04 106 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 OR10J1P30954 320 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RAB11AP62491 216 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 GAMTQ14353 236 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 DEFB125Q8N687 156 aa7.2□□□□□ -1.26
CS-217ENST00000550044 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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