RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 MUC21Q5SSG8 566 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 RCHY1Q96PM5 261 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 FREM3P0C091 2139 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 H0YJW9 148 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 JMJD1CQ15652 2540 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 FAM74A7A6NL05 159 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 SGK494Q96LW2 274 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 CGAP01215 116 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 CD8AP01732 235 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 FABP4P15090 132 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 COQ2Q96H96 371 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 AQP10Q96PS8 301 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.39□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 GP9P14770 177 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM86BQ8N661 226 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 Q8NA96 180 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 SHISA3A0PJX4 238 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 EFNB1P98172 346 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 F8VVB4 439 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 F8VWA3 439 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ATP6V0E1O15342 81 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 VENTXO95231 258 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZR03 302 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TCF23Q7RTU1 214 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ITGB1BP1O14713 200 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFB4O95168 129 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 GCHFRP30047 84 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.38□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 NAPSAO96009 420 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 LRTM2Q8N967 370 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 STPG2Q8N412 459 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 NPCDR1Q9BY65 106 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 C5orf63A6NC05 138 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 RAMP3O60896 148 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 MYCNOSP40205 109 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 FCN3O75636 299 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 C1QL4Q86Z23 238 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa8.37□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GWJ7 208 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 H3BRM9 83 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 LOXP28300 417 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 COTL1Q14019 142 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 KRTDAPP60985 99 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 RNF144BQ7Z419 303 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 CRYBB3P26998 211 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 FBLN7Q53RD9 439 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 XCL2Q9UBD3 114 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 LY6G6DO95868 133 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 REC114Q7Z4M0 266 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 ZNF253O75346 499 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 DKK1O94907 266 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 PSMB2P49721 201 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 INSL3P51460 131 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 CCL18P55774 89 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 AANATQ16613 207 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 IFT22Q9H7X7 185 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0A6YYD4 124 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.35□□□□□ -1.07
POLR1B-217ENST00000541869 PIFOQ8TCI5 191 aa8.35□□□□□ -1.07
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