RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF320A2RRD8 509 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM213A2RRL7 107 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 C2orf70A6NJV1 201 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 H0YIZ8 118 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 MPC2O95563 127 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 C8orf88P0DMB2 117 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 P2RY1P47900 373 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CAV2P51636 162 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PMS2P11Q13670 270 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR8G2PQ6IF36 304 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 THAP8Q8NA92 274 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 MARC2Q969Z3 335 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ACY3Q96HD9 319 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TRGV9Q99603 122 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CXorf65A6NEN9 183 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFP92A6NM28 416 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CCNKO75909 580 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 YIF1AO95070 293 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TOMM40O96008 361 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 FOLR2P14207 255 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CBLN1P23435 193 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 S100A11P31949 105 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SULT1A1P50225 295 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CD81P60033 236 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 CD300CQ08708 224 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 FGL1Q08830 312 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ARL16Q0P5N6 197 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TIGITQ495A1 244 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TM4SF20Q53R12 229 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 LCN12Q6JVE5 192 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 STX12Q86Y82 276 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 Q8WTZ3 238 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 GINS3Q9BRX5 216 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 RNF126Q9BV68 326 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-212ENST00000541770 IGSF23A1L1A6 192 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 CST7O76096 145 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 FABP1P07148 127 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 RD3LP0DJH9 198 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 RAP2BP61225 183 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 HBG1P69891 147 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 HBG2P69892 147 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 AKR1C1Q04828 323 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 BAXQ07812 192 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 VWC2Q2TAL6 325 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 SMLR1H3BR10 107 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 PSG1P11464 419 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 CRYBB3P26998 211 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF90Q03938 601 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 ATP6V1FQ16864 119 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 TEPPQ6URK8 271 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFB125Q8N687 156 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 THAP6Q8TBB0 222 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 NEURL2Q9BR09 285 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 MBD2Q9UBB5 411 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 SMPXQ9UHP9 88 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 SMCO3A2RU48 225 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 CHEK1O14757 476 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 IL4P05112 153 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 CD5P06127 495 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 EDN2P20800 178 aa6.5□□□□□ -1.37
CLSTN3-212ENST00000541770 NPPCP23582 126 aa6.5□□□□□ -1.37
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