RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	C4BPB	P20851	252 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	NPPC	P23582	126 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	OR2F1	Q13607	317 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	ATP5S	Q99766	215 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.69	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0D9SG52	128 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	NHLH2	Q02577	135 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730		Q6ZRG5	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	HYLS1	Q96M11	299 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	PSG1	P11464	419 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	CAMLG	P49069	296 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	ARL16	Q0P5N6	197 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF345	Q14585	488 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	MFF	Q9GZY8	342 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	RABAC1	Q9UI14	185 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	C2orf70	A6NJV1	201 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	SAP30	O75446	220 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	IL4	P05112	153 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	FGF7	P21781	194 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	CLINT1	Q14677	625 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	BTNL8	Q6UX41	500 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	AGPAT2	O15120	278 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	ARPC5	O15511	151 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	JTB	O76095	146 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	C1QB	P02746	253 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	CBLN1	P23435	193 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	PFDN5	Q99471	154 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	HYPM	O75409	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	C8orf88	P0DMB2	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	FOLR2	P14207	255 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PLP1	P60201	277 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	LCN12	Q6JVE5	192 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM213	A2RRL7	107 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	CSN3	P07498	182 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00869	P0C866	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	CRYBB3	P26998	211 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	LYZ	P61626	148 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PAFAH1B2	P68402	229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF90	Q03938	601 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZFP69	Q49AA0	526 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730		Q5BKY6	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	NEURL2	Q9BR09	285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	HELT	A6NFD8	242 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PFDN1	O60925	122 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	OPCML	Q14982	345 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TM4SF20	Q53R12	229 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BBS1-224	ENST00000534730	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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