RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HYPMO75409 117 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MBP02144 154 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IL4P05112 153 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5G3P0C626 314 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYZP61626 148 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR20EP86478 221 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR20CP86479 221 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR20DP86480 221 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR20BP86481 221 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRR20AP86496 221 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPEL1Q2QD12 228 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AWAT1Q58HT5 328 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR51G1Q8NGK1 321 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOK5Q9P104 306 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087WW49 117 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UMAD1C9J7I0 102 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 I3L521 148 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB2AP61019 212 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFITM2Q01629 132 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DEFB136Q30KP8 78 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR11H1Q8NG94 326 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VSIRQ9H7M9 311 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.55□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNCP24821 2201 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PPV4 95 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01619G3V211 115 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA4O00483 81 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M6PRP20645 277 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZP3P21754 424 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SULT1A2P50226 295 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB5CP51148 216 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB14P61106 215 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C12orf54Q6X4T0 127 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A7AQ86SG5 101 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF141Q8WVD5 230 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF125Q96EQ8 232 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DUX3Q96PT4 197 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PFDN5Q99471 154 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPRMQ9NS64 109 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RABAC1Q9UI14 185 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.54□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLXNB1O43157 2135 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCL24O00175 119 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPPCP23582 126 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A7P31151 101 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLURP1P55000 103 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNJ2BPP57105 145 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLP1P60201 277 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RHOBP62745 196 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM78BQ5VT40 261 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PATE2Q6UY27 113 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPHB5Q86YW7 130 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C3orf56Q8N813 242 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.53□□□□□ -1.36
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.53□□□□□ -1.36
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