RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522878.5

ARFGEF1-208, Transcript of ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARFGEF1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1-208ENST00000522878 OR52N1Q8NH53 320 aa3.52□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.52□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 BORCS7Q96B45 105 aa3.52□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 OR51I2Q9H344 312 aa3.52□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ENPP4Q9Y6X5 453 aa3.52□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ODF3BA8MYP8 253 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 M0QZK8 103 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 NDUFA2O43678 99 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SERF1AO75920 110 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 CRYGDP07320 174 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 CD24P25063 80 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 DAD1P61803 113 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 APOFQ13790 326 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 KCNJ8Q15842 424 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF678Q5SXM1 525 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 LINC00596Q86U02 117 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 DHFR2Q86XF0 187 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 MKXQ8IYA7 352 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 MALSU1Q96EH3 234 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ACY3Q96HD9 319 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 FAM210BQ96KR6 192 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 LINC00479Q96M42 142 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SPACA5Q96QH8 159 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 OR2M2Q96R28 347 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 HES4Q9HCC6 221 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa3.51□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 F5H5P2 479 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 GPR31O00270 319 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 OR2A4O95047 310 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 HBZP02008 142 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 PPBPP02775 128 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ATP5G1P05496 136 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ESDP10768 282 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 CD34P28906 385 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 S100GP29377 79 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 MARCKSL1P49006 195 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 HPCAP84074 193 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 CCDC153Q494R4 210 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 CENPWQ5EE01 88 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 STX19Q8N4C7 294 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF561Q8N587 486 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SLC35G5Q96KT7 338 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 OR2A7Q96R45 310 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 TMEM243Q9BU79 118 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 RWDD2AQ9UIY3 292 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF225Q9UK10 706 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 HSPB11Q9Y547 144 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 KMT2DO14686 5537 aa3.5□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 A0A0J9YXY3 114 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 C5orf49A4QMS7 147 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 K7EPK0 472 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 BHLHE40O14503 412 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 COPEO14579 308 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 FFAR1O14842 300 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 IGHV3-23P01764 117 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 APOC2P02655 101 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 TTRP02766 147 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 ZNF823P16415 610 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 S100A1P23297 94 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 PSMB8P28062 276 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 RBX1P62877 108 aa3.49□□□□□ -1.85
ARFGEF1-208ENST00000522878 PMAIP1Q13794 54 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.2 ms