RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 GADD45GO95257 159 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MT-CO2P00403 227 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 HPRT1P00492 218 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSHBP01222 138 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCGR3AP08637 254 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD3GP09693 182 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAPPC2P0DI81 140 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAPPC2BP0DI82 140 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CBX5P45973 191 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SERPINB10P48595 397 aa1.09□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MEOX2P50222 304 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAS2R43P59537 309 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP10-10P60014 251 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP1.09□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGL1Q08830 312 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPAN31Q12999 210 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB31Q13636 194 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FHL2Q14192 279 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 GK3PQ14409 553 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGSF11Q5DX21 431 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35D3Q5M8T2 416 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 IDNKQ5T6J7 187 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 HES5Q5TA89 166 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2G6Q5TZ20 316 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 STEAP1BQ6NZ63 245 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 VTCN1Q7Z7D3 282 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC190Q86UF4 302 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 DAND5Q8N907 189 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00304Q8N9R0 145 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10W1Q8NGF6 305 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1L8Q8NGR8 309 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR10J5Q8NHC4 309 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX47Q8TBZ9 253 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q8WTZ3 238 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 MZB1Q8WU39 189 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF479Q96JC4 524 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM56Q96MV1 263 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SH3GL1Q99961 368 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOL4Q9BPW4 351 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRADC1Q9BSG0 188 aa1.09□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 TEX12Q9BXU0 123 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAMD10Q9BYL1 202 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 RDH8Q9NYR8 311 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFA12Q9UI09 145 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 GMPPBQ9Y5P6 360 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENPP4Q9Y6X5 453 aa1.09□□□□□ -2.23
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RNU6-548P-201ENST00000517083 MEIS3P1A6NDR6 274 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4C45A6NMZ5 311 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 H3BN98 237 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 BET1O15155 118 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSTA4O15217 222 aa1.08□□□□□ -2.24
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RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLV7-43P04211 117 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL4P05112 153 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSG1P11464 419 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTHLHP12272 177 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSD17B1P14061 328 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 RRM2P31350 389 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUTP33316 252 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSSP48637 474 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERVK-16P61578 105 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP3R1P63098 170 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HLA-DRB3P79483 266 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 FOXI1Q12951 378 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF674Q2M3X9 581 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PAGE3Q5JUK9 113 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 AMTNQ6UX39 209 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q6ZQT7 251 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GAPTQ8N292 157 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC197Q8NCU1 140 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF738Q8NE65 137 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2G2Q8NGZ5 317 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1P1Q8NH06 330 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSKUQ8WUA8 353 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR146Q96CH1 333 aa1.08□□□□□ -2.24
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