RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAMTQ14353 236 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC35E1Q96K37 410 aa11.08□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFP92A6NM28 416 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 INPP1P49441 399 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R1AQ13522 171 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR8G2PQ6IF36 304 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNF125Q96EQ8 232 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SRRQ9GZT4 340 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MFFQ9GZY8 342 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NRN1Q9NPD7 142 aa11.07□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB40CQ96S21 281 aa11.06□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KNCNA6PVL3 124 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNGR2O43760 224 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMG4Q5JS54 123 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1orf194Q5T5A4 169 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PBDC1Q9BVG4 233 aa11.05□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOXB5P09067 269 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IAPPP10997 89 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF90Q03938 601 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIQKQ629K1 86 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRGV9Q99603 122 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXL17Q9UF56 701 aa11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CENPXA8MT69 81 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFB6O95139 128 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LY6G6CO95867 125 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.03□□□□□ -0.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C9orf170A2RU37 121 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WRBO00258 174 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MIFP14174 115 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BAK1Q16611 211 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THAP8Q8NA92 274 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COQ8AQ8NI60 647 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HRH4Q9H3N8 390 aa11.02□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SACSQ9NZJ4 4579 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFNA21P01568 189 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ID1P41134 155 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LYZP61626 148 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ID3Q02535 119 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNPY1Q3B7I2 92 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 Q8NAQ8 132 aa11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRSS46E5RG02 174 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BMM0 161 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DEFB4AO15263 64 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C4BPBP20851 252 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 S100A7P31151 101 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR2F1Q13607 317 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SAMD13Q5VXD3 122 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP1R14BQ96C90 147 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC45A2Q9UMX9 530 aa11□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LYSTQ99698 3801 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAP1O75689 374 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR4E1P0C645 316 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMB3P49720 205 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCTAP57738 103 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR8I2Q8N0Y5 310 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.99□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGRNO00468 2067 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C11orf94C9JXX5 98 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBMY1CP0DJD4 496 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HLA-DRB4P13762 266 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C4orf46Q504U0 113 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BPIFCQ8NFQ6 507 aa10.98□□□□□ -0.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C2CD4CQ8TF44 421 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms