RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 OR8I2Q8N0Y5 310 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 MAP1LC3AQ9H492 121 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 PTPRBP23467 1997 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 M0R1W7 72 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 SERF1AO75920 110 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 APCSP02743 223 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 NPSP0C0P6 89 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP5G3P48201 142 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 TFF3Q07654 80 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 MOB3BQ86TA1 216 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 WDR31Q8NA23 367 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 RFESDQ8TAC1 157 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 BAALCQ8WXS3 180 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 SCRT1Q9BWW7 348 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.22□□□□□ -1.89
ANKRD28-213ENST00000498524 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 COX7A2P2O60397 106 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 CD55P08174 381 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 GZMHP20718 246 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 ADMP35318 185 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 OPRK1P41145 380 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 PAX9P55771 341 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE5Q13069 117 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 GAGE6Q13070 117 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 TMEM191AQ9H0A3 160 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 OVOL3O00110 214 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV3-13P01766 116 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 HBZP02008 142 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 PAX2Q02962 417 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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ANKRD28-213ENST00000498524 MIC13Q5XKP0 118 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6ZSR3 168 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 FA2HQ7L5A8 372 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 LRRC29Q8WV35 223 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 MRAP2Q96G30 205 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 DNAJC13O75165 2243 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 EML5Q05BV3 1969 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 JMJD1CQ15652 2540 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A0G2JRQ6 117 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 SRRM5B3KS81 715 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 C3orf84H3BNL1 204 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 ISLRO14498 428 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 TMPRSS2O15393 492 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 IGKV1-5P01602 117 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 WNT2P09544 360 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A6P0DMU7 189 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A5P0DMU8 189 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A7P0DMV0 189 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 HTR1DP28221 377 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 GCHFRP30047 84 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 SRIP30626 198 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 EMP1P54849 157 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 TAL2Q16559 108 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A1Q5HYN5 189 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 OR1L1Q8NH94 360 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 KCNS1Q96KK3 526 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 YPEL4Q96NS1 127 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 POLQO75417 2590 aa3.21□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV24A0A0B4J272 114 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 H3BTX0 84 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 GNG7O60262 68 aa3.2□□□□□ -1.9
ANKRD28-213ENST00000498524 PLAUP00749 431 aa3.2□□□□□ -1.9
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