RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495446.1

UPP1-212, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 2,782 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-212ENST00000495446 OR2V2Q96R30 315 aa8.51□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.51□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 A0A1B0GXF2 115 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ZNF138P52744 262 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 C2orf83Q53S99 150 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SSX8Q7RTT4 187 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PRNDQ9UKY0 176 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 CBY3A6NI87 242 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 NUDT3O95989 172 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PSG1P11464 419 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 POU2AF1Q16633 256 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PAXXQ9BUH6 204 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 CACNA1BQ00975 2339 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 H3BTX0 84 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ZNF137PP52743 207 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MUC21Q5SSG8 566 aa8.5□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 FSTL3O95633 263 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 COTL1Q14019 142 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 RASL11AQ6T310 242 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PPP1R35Q8TAP8 253 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 BLNKQ8WV28 456 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 GTSF1Q8WW33 167 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 FXYD5Q96DB9 178 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 LRBAP50851 2863 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 H0Y8G0 127 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 K7ENP7 123 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 GUSBP1Q15486 140 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 Q6ZS92 163 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 NPIPB3Q92617 1050 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.49□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 COX7A2P2O60397 106 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 RTL8BQ17RB0 113 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 CGB1A6NKQ9 187 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 M0R1B8 84 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MOSP00540 346 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 IGLV1-44P01699 117 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 REG1BP48304 166 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 C19orf24Q9BVV8 132 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.48□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 IGHG3P01860 377 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MYCNOSP40205 109 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ZNF714Q96N38 554 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 CCL13Q99616 98 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 A0A087X0K7 114 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SNAI2O43623 268 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 LHBP01229 141 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 RHOGP84095 191 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 WT1-ASQ06250 92 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 Q8NA96 180 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 CST9LQ9H4G1 147 aa8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 PGPA6NDG6 321 aa8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 LEPROTL1O95214 131 aa8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 HBBP68871 147 aa8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.46□□□□□ -1.05
UPP1-212ENST00000495446 DKK4Q9UBT3 224 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms