RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 EDDM3BP56851 147 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TCF23Q7RTU1 214 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 GNB4Q9HAV0 340 aa5.88□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.88□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.88□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 B5MCH6 92 aa5.87□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A6P12236 298 aa5.87□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ATOH7Q8N100 152 aa5.87□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8B2Q96RD0 313 aa5.87□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 A1L4Q6 167 aa5.87□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 F2Z2F3 143 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 M0QXV9 152 aa5.87□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 GPR183P32249 361 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 DYNLT3P51808 116 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C8orf46Q8TAG6 207 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 IL1F10Q8WWZ1 152 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 C18orf12Q96KH6 178 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.87□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5.87□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM187Q14656 261 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM213A2RRL7 107 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 H0Y980 276 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFSF12O43508 249 aa5.86□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV4-39P01824 125 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 FABP2P12104 132 aa5.86□□□□□ -1.47
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SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ACSM6Q6P461 480 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF714Q96N38 554 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 NAA60Q9H7X0 242 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SCRT2Q9NQ03 307 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 RPRMQ9NS64 109 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.86□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 DOCK11Q5JSL3 2073 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 F8W1H4 67 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 FCN1O00602 326 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 LY6HO94772 140 aa5.85□□□□□ -1.47
SMARCE1-211ENST00000493660 SPINK8P0C7L1 97 aa5.85□□□□□ -1.47
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