RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 AKAP14Q86UN6 197 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 STX12Q86Y82 276 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM252Q8N6L7 170 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 SLC35E1Q96K37 410 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TXN2Q99757 166 aa8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 IGSF23A1L1A6 192 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 OR11H12B2RN74 326 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 SMLR1H3BR10 107 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 GNG7O60262 68 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 SLC25A4P12235 298 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 NPBWR1P48145 328 aa8.66□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF546Q86UE3 836 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM217Q8N7C4 229 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 ACY3Q96HD9 319 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.66□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.65□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.65□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 CBLN1P23435 193 aa8.65□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 S100A11P31949 105 aa8.65□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 GPR183P32249 361 aa8.65□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 DLK1P80370 383 aa8.65□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 NHLH2Q02577 135 aa8.65□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 ARL16Q0P5N6 197 aa8.65□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 OR1S2Q8NGQ3 325 aa8.65□□□□□ -1.02
GARNL3-217ENST00000481875 OR4X1Q8NH49 305 aa8.65□□□□□ -1.02
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GARNL3-217ENST00000481875 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.64□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.64□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.64□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 PPP5D1E7EU14 171 aa8.64□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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GARNL3-217ENST00000481875 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
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GARNL3-217ENST00000481875 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.63□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 MARC2Q969Z3 335 aa8.63□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 GGACTQ9BVM4 153 aa8.63□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.63□□□□□ -1.03
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GARNL3-217ENST00000481875 HSPB11Q9Y547 144 aa8.63□□□□□ -1.03
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GARNL3-217ENST00000481875 G3V3Q6 166 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 ARPC5O15511 151 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 CTSGP08311 255 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 CLINT1Q14677 625 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TIGITQ495A1 244 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.62□□□□□ -1.03
GARNL3-217ENST00000481875 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.62□□□□□ -1.03
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