RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 MAGEA2P43356 314 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 ESRGQ1W209 222 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 SPATA45Q537H7 98 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 COQ5Q5HYK3 327 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 SDHAF4Q5VUM1 108 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 WFDC10AQ9H1F0 79 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 OR51V1Q9H2C8 321 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 RNF11Q9Y3C5 154 aa-1.45□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 VWFP04275 2813 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 GPR31O00270 319 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 RD3LP0DJH9 198 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 MARCKSL1P49006 195 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 SPAG11BQ08648 103 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 PPP1R1AQ13522 171 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 KLK9Q2XQG4 91 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 DEFB109BQ30KR1 87 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 OR8D4Q8NGM9 314 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 TMEM254Q8TBM7 123 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 ERGIC3Q9Y282 383 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 SIP14410 1827 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 STARD9Q9P2P6 4700 aa-1.46□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 SPTBN2O15020 2390 aa-1.47□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 MED13LQ71F56 2210 aa-1.47□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa-1.47□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 BRMS1LQ5PSV4 323 aa-1.47□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 IDO2Q6ZQW0 420 aa-1.47□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 Q8N402 240 aa-1.47□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 SLC39A9Q9NUM3 307 aa-1.47□□□□□ -2.64
SSB-208ENST00000468600 DOCK4Q8N1I0 1966 aa-1.47□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa-1.48□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa-1.48□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 UGT2B7P16662 529 aa-1.48□□□□□ -2.65
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SSB-208ENST00000468600 HBA1P69905 142 aa-1.48□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 RSU1Q15404 277 aa-1.48□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 Q3ZCU0 254 aa-1.48□□□□□ -2.65
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SSB-208ENST00000468600 Q86TA4 180 aa-1.48□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
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SSB-208ENST00000468600 SMLR1H3BR10 107 aa-1.49□□□□□ -2.65
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SSB-208ENST00000468600 CD14P08571 375 aa-1.49□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 C2orf82Q6UX34 121 aa-1.49□□□□□ -2.65
SSB-208ENST00000468600 Q6ZQY7 126 aa-1.49□□□□□ -2.65
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SSB-208ENST00000468600 C7orf71A4D174 169 aa-1.5□□□□□ -2.65
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SSB-208ENST00000468600 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.54□□□□□ -2.66
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