RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	YIF1A	O95070	293 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	TSPAN15	O95858	294 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	PSG1	P11464	419 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	S100A7	P31151	101 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	B2M	P61769	119 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	DEFB136	Q30KP8	78 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602		Q6ZRG5	221 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	S100A7A	Q86SG5	101 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	BAP18	Q8IXM2	172 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	STOML3	Q8TAV4	291 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	RAX2	Q96IS3	184 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARV1	Q9H2C2	271 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	COL6A5	A8TX70	2615 aa		7.21	□□□□□ -1.25
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF320	A2RRD8	509 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	LGALS9	O00182	355 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PF4	P02776	101 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	LINC00869	P0C866	280 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATP6V0C	P27449	155 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SERF2	P84101	59 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRR20E	P86478	221 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRR20C	P86479	221 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRR20D	P86480	221 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRR20B	P86481	221 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRR20A	P86496	221 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	FHL3	Q13643	280 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	MIC13	Q5XKP0	118 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	REC114	Q7Z4M0	266 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	C1QL4	Q86Z23	238 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	STPG3	Q8N7X2	389 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF125	Q96EQ8	232 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	RSG1	Q9BU20	258 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602		K7EMT4	169 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602		M0QZ24	198 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	HYPM	O75409	117 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	MB	P02144	154 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL4	P05112	153 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SEC11B	P0C7V7	166 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ORM2	P19652	201 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLURP1	P55000	103 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SYNJ2BP	P57105	145 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PLP1	P60201	277 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	LYZ	P61626	148 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	DUX3	Q96PT4	197 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PFDN5	Q99471	154 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	MDFI	Q99750	246 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	COX7A2P2	O60397	106 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPP1	P10451	314 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPPC	P23582	126 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	BMI1	P35226	326 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ST8SIA2	Q92186	375 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	MARC2	Q969Z3	335 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	METTL26	Q96S19	204 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF2	Q99496	336 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP4-208	ENST00000462602	RABAC1	Q9UI14	185 aa		7.19	□□□□□ -1.26

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