RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 RUNX1Q01196 453 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP5G2Q06055 141 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZRG5 221 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 GNB4Q9HAV0 340 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 THYN1Q9P016 225 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 DOK5Q9P104 306 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGEF1-205ENST00000450873 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
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RABGEF1-205ENST00000450873 OR2J3O76001 311 aa8.21□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf50Q96LR7 162 aa8.21□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 PRO1933Q9H354 126 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 SMCO3A2RU48 225 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4D5Q8NGN0 318 aa8.18□□□□□ -1.1
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RABGEF1-205ENST00000450873 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-205ENST00000450873 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.18□□□□□ -1.1
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