RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449508.1

TOM1-211, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 4

Gene TOM1, Length 593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-211ENST00000449508 CNPY1Q3B7I2 92 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 Q8NAQ8 132 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 CLEC5AQ9NY25 188 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.95□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 DEDDO75618 318 aa9.95□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.95□□□□□ -0.82
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TOM1-211ENST00000449508 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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TOM1-211ENST00000449508 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 PBDC1Q9BVG4 233 aa9.95□□□□□ -0.82
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TOM1-211ENST00000449508 ZFP92A6NM28 416 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 IGLL5B9A064 214 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 C11orf94C9JXX5 98 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 GAMTQ14353 236 aa9.94□□□□□ -0.82
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TOM1-211ENST00000449508 TMED4Q7Z7H5 227 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 RNF125Q96EQ8 232 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 HRH4Q9H3N8 390 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 X6R8D5 127 aa9.94□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 HLA-DMBP28068 263 aa9.93□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 TCTAP57738 103 aa9.93□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 AP3S2P59780 193 aa9.93□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 ZNF90Q03938 601 aa9.93□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.93□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 SLC35E1Q96K37 410 aa9.93□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 VAMP1P23763 118 aa9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 RAB11AP62491 216 aa9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 XCL2Q9UBD3 114 aa9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 APLNQ9ULZ1 77 aa9.92□□□□□ -0.82
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TOM1-211ENST00000449508 LYZP61626 148 aa9.91□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.91□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 MED6O75586 246 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 S100A5P33763 92 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 ID1P41134 155 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 OR2F1Q13607 317 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 Q6ZTC4 211 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 LRTM2Q8N967 370 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 TRIM63Q969Q1 353 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 LINC00052Q96N35 136 aa9.9□□□□□ -0.82
TOM1-211ENST00000449508 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 IGKV3-20P01619 116 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 SLC25A6P12236 298 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 HLA-DRB4P13762 266 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOM1-211ENST00000449508 PRR20EP86478 221 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 PRR20CP86479 221 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 PRR20DP86480 221 aa9.89□□□□□ -0.83
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TOM1-211ENST00000449508 PRR20AP86496 221 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 C1orf194Q5T5A4 169 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 GDF5OSQ5U4N7 250 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 TRGV9Q99603 122 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 V9GYH0 126 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 WRBO00258 174 aa9.88□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 SYNGR2O43760 224 aa9.88□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 SFT2D2O95562 160 aa9.88□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 HOXB5P09067 269 aa9.88□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 DEFB1P60022 68 aa9.88□□□□□ -0.83
TOM1-211ENST00000449508 PPP1R1AQ13522 171 aa9.88□□□□□ -0.83
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