RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAMTQ14353 236 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIGITQ495A1 244 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCF24Q7RTU0 167 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THAP8Q8NA92 274 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF125Q96EQ8 232 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RCHY1Q96PM5 261 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF2Q99496 336 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GGACTQ9BVM4 153 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXL17Q9UF56 701 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RABAC1Q9UI14 185 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 U3KQE9 123 aa6.41□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS46E5RG02 174 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 P2RY1P47900 373 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SELENOTP62341 195 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLK1P80370 383 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HAGHQ16775 308 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM144Q7Z5S9 345 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ST8SIA2Q92186 375 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSENENQ9NZ42 101 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.4□□□□□ -1.38
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SSSCA1O60232 199 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSG1P11464 419 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKR1C1Q04828 323 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MLANAQ16655 118 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEFB125Q8N687 156 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2orf50Q96LR7 162 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR82Q96P67 336 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CITED4Q96RK1 184 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASCL2Q99929 193 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C5orf51A6NDU8 294 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MPTX1A8MV57 137 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C3orf84H3BNL1 204 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7EPK0 472 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 L7N2F9 121 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BUB3O43684 328 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCGB1D2O95969 90 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MEOX2P50222 304 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VAMP2P63027 116 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q6ZWC4 215 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL17DQ8TAD2 202 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLMPQ8WWB7 406 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRN1Q9NPD7 142 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.38□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C7orf66A4D0T2 115 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM25EA8MYX2 175 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H3BP45 60 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7EQG2 157 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEDDO75618 318 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTTG1O95997 202 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PET100P0DJ07 73 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HBG1P69891 147 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HBG2P69892 147 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB31Q13636 194 aa6.37□□□□□ -1.39
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEPPQ6URK8 271 aa6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms