RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401088.8

SZRD1-201, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SZRD1, Length 3,636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-201ENST00000401088 C3AR1Q16581 482 aa10.02□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 WDR86Q86TI4 376 aa10.02□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IFI27L2Q9H2X8 130 aa10.02□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 METRNQ9UJH8 293 aa10.02□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 K7EMI3 77 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 NXPH1P58417 271 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 GUSBP11Q6P575 273 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 MBD6Q96DN6 1003 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CFAP161Q6P656 301 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 VWC2LB2RUY7 222 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CT45A10P0DMU9 189 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ERVK11-1P61568 191 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CCL7P80098 99 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 NRN1LQ496H8 165 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IFI27L1Q96BM0 104 aa10.01□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 F8W1H4 67 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 UBALD2Q8IYN6 164 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ANAPC13Q9BS18 74 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LINC00470Q9BZP3 86 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CYSLTR1Q9Y271 337 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LOXL2Q9Y4K0 774 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1B0GXF2 115 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 PRDX2P32119 198 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 GTSF1Q8WW33 167 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 RND1Q92730 232 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 HIST1H4GQ99525 98 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 PROK2Q9HC23 129 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 PRSS46E5RG02 174 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 PPIFP30405 207 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 FXYD2P54710 66 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SPINK14Q6IE38 97 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A45Q8N413 288 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 RPRMLQ8N4K4 120 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 PRELID3AQ96N28 172 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PR77 199 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 C2CD4DB7Z1M9 353 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 DLL1O00548 723 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 MGST3O14880 152 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SFTA2Q6UW10 78 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 Q8TCH9 128 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 C1orf159Q96HA4 380 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CD69Q07108 199 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SMPXQ9UHP9 88 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 JPT1Q9UK76 154 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 REV3LO60673 3130 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 B3GALT5-AS1P59052 145 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SYT8Q8NBV8 401 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 OR5AN1Q8NGI8 311 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.99□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 HBDP02042 147 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CKS2P33552 79 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 MPV17P39210 176 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 DEFB108BQ8NET1 73 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 PLCE1Q9P212 2302 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 NKX2-8O15522 239 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CNIH1O95406 144 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF766Q5HY98 468 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 FAM222BQ8WU58 562 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 RAB9BQ9NP90 201 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 D6R8Y8 96 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 COX6A1P12074 109 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ZNRF1Q8ND25 227 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 FMC1Q96HJ9 113 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 EYSQ5T1H1 3165 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PRD5 423 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PRF3 423 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 A0A1W2PRM7 423 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LYZL6O75951 148 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 CFHR2P36980 270 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.97□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 SIVA1O15304 175 aa9.96□□□□□ -0.81
SZRD1-201ENST00000401088 APELAP0DMC3 54 aa9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms