RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PSG1P11464 419 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 ORM2P19652 201 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PRR20EP86478 221 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PRR20CP86479 221 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PRR20DP86480 221 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PRR20BP86481 221 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PRR20AP86496 221 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 FAM122CQ6P4D5 195 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PPP5D1E7EU14 171 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 F8W735 103 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 CTSGP08311 255 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 RHOBP62745 196 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 DPF1Q92782 380 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.43□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 RPEL1Q2QD12 228 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 FAM78BQ5VT40 261 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 RNF125Q96EQ8 232 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 VSIRQ9H7M9 311 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 RABAC1Q9UI14 185 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 RNF24Q9Y225 148 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 ZFHX3Q15911 3703 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1W2PRX2 142 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 OR2C1O95371 312 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 HBE1P02100 147 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 ADMP35318 185 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PROK1P58294 105 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R45P59539 299 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 PLP1P60201 277 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf24Q9BUV8 137 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A22Q9H936 323 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 RPRMQ9NS64 109 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 TRBV12-3P01733 135 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 ZP3P21754 424 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRK-201ENST00000368202 KHDC3LQ587J8 217 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRK-201ENST00000368202 LINC01619G3V211 115 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 I3L521 148 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 NPPCP23582 126 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 FHITP49789 147 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 LCN15Q6UWW0 184 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PTPRK-201ENST00000368202 RAB24Q969Q5 203 aa9.39□□□□□ -0.91
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