RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 GAGE12GP0CL81 117 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAGE12IP0CL82 117 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LYL1P12980 280 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 VDAC1P21796 283 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FOXL1Q12952 345 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 GAGE4Q13068 117 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 BAALCQ8WXS3 180 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 MALSU1Q96EH3 234 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.9□□□□□ -1.62
CCR6-201ENST00000341935 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A0G2JRQ6 117 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TMEM89A2RUT3 159 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PSMB11A5LHX3 300 aa4.9□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 FCGR3BO75015 233 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1-5P01602 117 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A4P12235 298 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MDKP21741 143 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CLEC12BQ2HXU8 276 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 C11orf87Q6NUJ2 197 aa4.9□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.9□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 PPP5D1E7EU14 171 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SPINK8P0C7L1 97 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CT45A6P0DMU7 189 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CT45A5P0DMU8 189 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 CT45A7P0DMV0 189 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 COX7A1P24310 79 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IL3RAP26951 378 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ZNF137PP52743 207 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ID3Q02535 119 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 VMO1Q7Z5L0 202 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PNKDQ8N490 385 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 GPR146Q96CH1 333 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IGLV1-47P01700 117 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A6P12236 298 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A16P16260 332 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 G6PCP35575 357 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TMED6Q8WW62 240 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ZNF345Q14585 488 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ADIRFQ15847 76 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RPEL1Q2QD12 228 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IL34Q6ZMJ4 242 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 OR11H6Q8NGC7 330 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RNF126Q9BV68 326 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RBKSQ9H477 322 aa4.89□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 PEMTQ9UBM1 199 aa4.89□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 P0C879 139 aa4.88□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KLRD1Q13241 179 aa4.88□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 RASL11AQ6T310 242 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 RCHY1Q96PM5 261 aa4.88□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GV50 99 aa4.88□□□□□ -1.63
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CCR6-201ENST00000341935 ZNF727A8MUV8 499 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 ODF3BA8MYP8 253 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 H0YIZ8 118 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 DEDDO75618 318 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KRASP01116 189 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 KIR2DL5AQ8N109 375 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 MBD6Q96DN6 1003 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 NABP2Q9BQ15 211 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 USF3Q68DE3 2245 aa4.88□□□□□ -1.63
CCR6-201ENST00000341935 TACC2O95359 2948 aa4.88□□□□□ -1.63
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