RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00312Q9Y6C7 94 aa6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 IL18BPO95998 194 aa6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 REG1AP05451 166 aa6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 PMS2CLQ68D20 193 aa6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PKHD1-201ENST00000340994 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.9□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 OCC1Q8TAD7 63 aa6.9□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 DUX3Q96PT4 197 aa6.9□□□□□ -1.3
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PKHD1-201ENST00000340994 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.9□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.89□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 IGKV3-11P04433 115 aa6.89□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 YPEL1O60688 119 aa6.89□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 YPEL2Q96QA6 119 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 SOCS3O14543 225 aa6.89□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.89□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 IGKV3-15P01624 115 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 SFTA2Q6UW10 78 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 D6R8Y8 96 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 PRCDQ00LT1 54 aa6.89□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.88□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 PDE6HQ13956 83 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 B9A039 149 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 OVOL1O14753 267 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 CCL8P80075 99 aa6.88□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 J3QRE1 110 aa6.88□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 A0A0J9YW62 118 aa6.88□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 TRGV9Q99603 122 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZT83 130 aa6.88□□□□□ -1.31
PKHD1-201ENST00000340994 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.87□□□□□ -1.31
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PKHD1-201ENST00000340994 HLA-DMBP28068 263 aa6.87□□□□□ -1.31
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