RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 BMPR1BO00238 502 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NDUFS7O75251 213 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 RBP4P02753 201 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TDGF1P3P51864 188 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM68Q96MH6 324 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.95□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 DLL1O00548 723 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TGOLN2O43493 480 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 MT-CO2P00403 227 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 C2orf83Q53S99 150 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NUDT11Q96G61 164 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PSMB11A5LHX3 300 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 ZNF329Q86UD4 541 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NDUFAF3Q9BU61 184 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 BET1LQ9NYM9 111 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.94□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 GCGP01275 180 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 OR5B3Q8NH48 314 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 FXYD5Q96DB9 178 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PS18 150 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 HIGD1CA8MV81 97 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PPOXP50336 477 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 FXYD7P58549 80 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 INSIG2Q9Y5U4 225 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PEX7O00628 323 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CSN3P07498 182 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CD99P14209 185 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 HES1Q14469 280 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NUP35Q8NFH5 326 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 C11orf52Q96A22 123 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NEU1Q99519 415 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NRN1Q9NPD7 142 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.93□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CCL21O00585 134 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CNIH1O95406 144 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 M0R3E3 92 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TCAPO15273 167 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TPPP2P59282 170 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TAS2R45P59539 299 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CX3CL1P78423 397 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 POU2AF1Q16633 256 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 Q56UQ5 140 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CORO2AQ92828 525 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 CREBBPQ92793 2442 aa6.92□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 DIRC3C9JPN6 131 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 APCSP02743 223 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PSG1P11464 419 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TBR1Q16650 682 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM177Q53S58 311 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 PRNTQ86SH4 94 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 NUP37Q8NFH4 326 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TMEM133Q9H2Q1 129 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 C9JCJ5 164 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 TIMM23O14925 209 aa6.91□□□□□ -1.3
GINS1-201ENST00000262460 FSTL3O95633 263 aa6.91□□□□□ -1.3
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