RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH17Q9UFH2 4485 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 DHRS2Q13268 280 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 LHFPL1Q86WI0 220 aa18.45■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SP6Q3SY56 376 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 GLMPQ8WWB7 406 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ENY2Q9NPA8 101 aa18.44■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 RYR1P21817 5038 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 HELTA6NFD8 242 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 SCGB2A1O75556 95 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ELK1P19419 428 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM16LQ309B1 348 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf54Q6UWD8 224 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 POM121L12Q8N7R1 296 aa18.43■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL8CO15255 209 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG12O94817 140 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLC1P0CG04 106 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 Q6ZRM9 215 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 KLK11Q9UBX7 282 aa18.42■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS29PA6NIE9 313 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 M0R2N4 97 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 HPGDSO60760 199 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 P0DMU3 169 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM231AP0DMU4 169 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM231CP0DMU5 169 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 MED14OSP0DP75 135 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 S100A5P33763 92 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
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CAPNS1-211ENST00000590874 MZT2AQ6P582 158 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 S100ZQ8WXG8 99 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 XCL2Q9UBD3 114 aa18.41■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 CD3DP04234 171 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFAF3Q9BU61 184 aa18.4■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH11Q96DT5 4516 aa18.39■□□□□ 0.54
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 UCP1P25874 307 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RND2P52198 227 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS54Q6PEW0 395 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ARRDC1Q8N5I2 433 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1S2Q8NGQ3 325 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 COPZ2Q9P299 210 aa18.39■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SPCS3P61009 180 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DHODHQ02127 395 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 AARDQ4LEZ3 155 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4D10Q8NGI6 311 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8WTZ3 238 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa18.38■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BMM0 161 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR10J1P30954 320 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR2BP41595 481 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13C8Q8NGS7 320 aa18.37■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52I2Q8NH67 350 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NRN1Q9NPD7 142 aa18.36■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 IL4P05112 153 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf83Q53S99 150 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52E5Q8NH55 327 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFAND1Q8TCF1 268 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM170AQ8WVE7 144 aa18.35■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM25AB3EWG3 89 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM25CB3EWG5 89 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM25GB3EWG6 89 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RGS5O15539 181 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A4P12235 298 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NPY1RP25929 384 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF846Q147U1 533 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 LHFPL5Q8TAF8 219 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MTFP1Q9UDX5 166 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA13Q86UQ4 5058 aa18.34■□□□□ 0.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CTDSP2O14595 271 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 BUB3O43684 328 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 NXPH3O95157 252 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5AC1P0C628 307 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DRB4P13762 266 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TBPP20226 339 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS9BQ3B8N2 356 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM219AQ8IW50 185 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TERB2Q8NHR7 220 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH1Q8TCQ1 289 aa18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
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