RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TIGIT	Q495A1	244 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	NECAP1	Q8NC96	275 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	NPB	Q8NG41	125 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	NPIPB3	Q92617	1050 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	OSTC	Q9NRP0	149 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	DPM3	Q9P2X0	92 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CAD	P27708	2225 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CEP250	Q9BV73	2442 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PIEZO1	Q92508	2521 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914		A0A0U1RQK1	487 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF320	A2RRD8	509 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ODF3B	A8MYP8	253 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	GGTLC3	B5MD39	225 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TEX22	C9J3V5	150 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	HYPM	O75409	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TOX4	O94842	621 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	GOSR1	O95249	250 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	GCG	P01275	180 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	SOD3	P08294	240 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TNXA	Q16473	311 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	MLANA	Q16655	118 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CENPW	Q5EE01	88 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	S100A7A	Q86SG5	101 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	RITA1	Q96K30	269 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PAXX	Q9BUH6	204 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRORY	Q9H606	182 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	NIT2	Q9NQR4	276 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	RNF24	Q9Y225	148 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	APC2	O95996	2303 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	XKRY2	A2RUG3	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914		K7EN84	100 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	NBR2	O15453	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	NDUFA3	O95167	84 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	MOS	P00540	346 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	MT-ND6	P03923	174 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	LYNX1	P0DP58	116 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	COX7A1	P24310	79 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CRYBB3	P26998	211 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	MYCNOS	P40205	109 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF90	Q03938	601 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPEL1	Q2QD12	228 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PATE2	Q6UY27	113 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR5T1	Q8NG75	326 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	FXYD5	Q96DB9	178 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.73	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	SVIL	O95425	2214 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914		A6NNC1	897 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914		I3L2K1	104 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PEX7	O00628	323 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TIMM23	O14925	209 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	MFAP2	P55001	183 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ERVFC1-1	P60608	527 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	CTAG1A	P78358	180 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	EBI3	Q14213	229 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PYY3	Q5JQD4	70 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF329	Q86UD4	541 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR5R1	Q8NH85	324 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMEM18	Q96B42	140 aa		5.72	□□□□□ -1.49
EFTUD2-208	ENST00000587914	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms