RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM187Q14656 261 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 STHQ8IWL8 128 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 RAB2BQ8WUD1 216 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 PRR13Q9NZ81 148 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 RABL2BQ9UNT1 228 aa18.59■□□□□ 0.57
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 OR1S2Q8NGQ3 325 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 C11orf45Q8TAV5 145 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 U3KQE9 123 aa18.58■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 DEFB4AO15263 64 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SLC25A4P12235 298 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 DCANP1Q8TF63 244 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 Q8WTZ3 238 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 GRAMD2BQ96HH9 432 aa18.57■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF688P0C7X2 276 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 OR10J1P30954 320 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 TMBIM6P55061 237 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 IL22RA2Q969J5 263 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 FBXL17Q9UF56 701 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 KMT2AQ03164 3969 aa18.56■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 KNCNA6PVL3 124 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SULT1A3P0DMM9 295 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SULT1A4P0DMN0 295 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 NPY1RP25929 384 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa18.55■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 NMSQ5H8A3 153 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 C16orf54Q6UWD8 224 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 NPIPB3Q92617 1050 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 BCL7BQ9BQE9 202 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 MFFQ9GZY8 342 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 AGRNO00468 2067 aa18.54■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 DHRS2Q13268 280 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 GLMPQ8WWB7 406 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SOSTQ9BQB4 213 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 MCUBQ9NWR8 336 aa18.53■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 IL4P05112 153 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 AKR1C4P17516 323 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 LYZL2Q7Z4W2 148 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 ACY3Q96HD9 319 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 SCGB3A2Q96PL1 93 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 CACFD1Q9UGQ2 172 aa18.52■□□□□ 0.56
SPNS1-209ENST00000567771 A0A0B4J2A0 478 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 HELTA6NFD8 242 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 IFNA10P01566 189 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 C4BPBP20851 252 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 TNFSF8P32971 234 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 ACTL10Q5JWF8 245 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 NOXA1Q86UR1 476 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 Q8NAQ8 132 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 SHPKQ9UHJ6 478 aa18.51■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 FABP12A6NFH5 140 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 IFNA4P05014 189 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 SPP1P10451 314 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 CCR6P51684 374 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 SMCO1Q147U7 214 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 LGALS9CQ6DKI2 356 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 DTD1Q8TEA8 209 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 RBKSQ9H477 322 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 HSPB7Q9UBY9 170 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 U3KQ87 197 aa18.5■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 H3BMQ9 156 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 TOMM40O96008 361 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 RD3LP0DJH9 198 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM41BQ5BJD5 291 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 PSMG4Q5JS54 123 aa18.49■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 DEDDO75618 318 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 LGI3Q8N145 548 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 RAB40CQ96S21 281 aa18.48■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 BUB3O43684 328 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 RBMY1CP0DJD4 496 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 PSG1P11464 419 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 CLEC5AQ9NY25 188 aa18.47■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 ANXA3P12429 323 aa18.46■□□□□ 0.55
SPNS1-209ENST00000567771 MCFD2Q8NI22 146 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms