RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	TRGV9	Q99603	122 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SHISA9	B4DS77	424 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PRRX1	P54821	245 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM12	Q96EX1	92 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CORT	O00230	105 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GPX1	P07203	203 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TCF15	Q12870	199 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559		Q8NA96	180 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559		E7EQL1	145 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559		M0R143	59 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	APCS	P02743	223 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SLC35B1	P78383	322 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00479	Q96M42	142 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		14.8	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559		B9A039	149 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559		F2Z2F3	143 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF253	O75346	499 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-48	P01763	117 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MYCNOS	P40205	109 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CASP6	P55212	293 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MBD6	Q96DN6	1003 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	KCNS1	Q96KK3	526 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	BMPR1B	O00238	502 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	REG1A	P05451	166 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2G1	P62253	170 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	PAX2	Q02962	417 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RBPJ	Q06330	500 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TBR1	Q16650	682 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	RITA1	Q96K30	269 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ORM2	P19652	201 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	EPDR1	Q9UM22	224 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	C22orf46	C9J442	243 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HYPM	O75409	117 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	CD33	P20138	364 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	SRI	P30626	198 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	TNXA	Q16473	311 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	HCP5	Q6MZN7	132 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	NUDT11	Q96G61	164 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	VAMP8	Q9BV40	100 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		14.77	□□□□□ -0.04
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CRYGB	P07316	175 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559		M0QZK8	103 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV1-47	P01700	117 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	RNF224	P0DH78	156 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	AMT	P48728	403 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TSKU	Q8WUA8	353 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	FAM168A	Q92567	244 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PS18	150 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	EREG	O14944	169 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	MOS	P00540	346 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	RBP4	P02753	201 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CD3E	P07766	207 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	RAB4A	P20338	218 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN1A	P38936	164 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	CA7	P43166	264 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	PLP1	P60201	277 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RRN3-205	ENST00000563559	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms