RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558907.5

RNF31-208, Transcript of ring finger protein 31, human

TSL 3

Gene RNF31, Length 777 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF31-208	ENST00000558907	CRYBB3	P26998	211 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	CCR6	P51684	374 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	DEFB131A	P59861	70 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	NMS	Q5H8A3	153 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907		A0A0B4J2A0	478 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	IFNA10	P01566	189 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	IGLC1	P0CG04	106 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	ANXA3	P12429	323 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	OR10J1	P30954	320 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	P2RY1	P47900	373 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	SMCO1	Q147U7	214 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	LEMD1	Q68G75	181 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	NOXA1	Q86UR1	476 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	LGI3	Q8N145	548 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907		Q8WTZ3	238 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907		V9GYH0	126 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	AP3S2	P59780	193 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	SRPX	P78539	464 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	DTD1	Q8TEA8	209 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	RBKS	Q9H477	322 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	S100A5	P33763	92 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907		K7EQG2	157 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	ZNF79	Q15937	498 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	RARRES2	Q99969	163 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907		U3KQ87	197 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907		U3KQE9	123 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RNF31-208	ENST00000558907	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	IL4	P05112	153 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	STH	Q8IWL8	128 aa		12.02	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	HELT	A6NFD8	242 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	TOMM40	O96008	361 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	IFNA4	P05014	189 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	ZNF688	P0C7X2	276 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	RD3L	P0DJH9	198 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	VAMP1	P23763	118 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	DCANP1	Q8TF63	244 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	GLMP	Q8WWB7	406 aa		12.01	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		12	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	KNCN	A6PVL3	124 aa		12	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	DHRS2	Q13268	280 aa		12	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	LYST	Q99698	3801 aa		12	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	PSG1	P11464	419 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.99	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	PITX3	O75364	302 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	IAPP	P10997	89 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	GAMT	Q14353	236 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	LRTM2	Q8N967	370 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	SLC35E1	Q96K37	410 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	ZFP92	A6NM28	416 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	DEFB4A	O15263	64 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	BUB3	O43684	328 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	SFT2D2	O95562	160 aa		11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
RNF31-208	ENST00000558907	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.97	□□□□□ -0.49

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