RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551098.5

DDX23-208, Transcript of DEAD-box helicase 23, human

TSL 2

Gene DDX23, Length 1,083 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX23-208	ENST00000551098	RND2	P52198	227 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	SMCO1	Q147U7	214 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF124	Q15973	351 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098		Q8WTZ3	238 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	RNF183	Q96D59	192 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	CSTL1	Q9H114	145 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	RABAC1	Q9UI14	185 aa		12.86	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098		A0A0J9YWU9	116 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	MPTX1	A8MV57	137 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	IGKV1-17	P01599	117 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	OR10J1	P30954	320 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	TNFRSF9	Q07011	255 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	NMS	Q5H8A3	153 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	OR1S1	Q8NH92	325 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098		U3KQ87	197 aa		12.85	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	CRYBB3	P26998	211 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	LYG2	Q86SG7	212 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	DTD1	Q8TEA8	209 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	ACY3	Q96HD9	319 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	RBKS	Q9H477	322 aa		12.84	□□□□□ -0.35
DDX23-208	ENST00000551098	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	CXorf65	A6NEN9	183 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	IGLC1	P0CG04	106 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	VAMP1	P23763	118 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	P2RY1	P47900	373 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	DEFB131A	P59861	70 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	NPIPB3	Q92617	1050 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	TRIM63	Q969Q1	353 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098		V9GYH0	126 aa		12.83	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	IFNA4	P05014	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	LEMD1	Q68G75	181 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		12.82	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	RYR2	Q92736	4967 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	RD3L	P0DJH9	198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	INPP1	P49441	399 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	PMS2P11	Q13670	270 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		12.81	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	HELT	A6NFD8	242 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	IL4	P05112	153 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF79	Q15937	498 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	CCDC190	Q86UF4	302 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	STH	Q8IWL8	128 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	RARRES2	Q99969	163 aa		12.8	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098		K7EQG2	157 aa		12.79	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	TOMM40	O96008	361 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	ZNF688	P0C7X2	276 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	RAB11A	P62491	216 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	DHRS2	Q13268	280 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098		U3KQE9	123 aa		12.78	□□□□□ -0.36
DDX23-208	ENST00000551098	NUPR2	A6NF83	97 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	ZFP92	A6NM28	416 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	MED6	O75586	246 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	SFT2D2	O95562	160 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	PSG1	P11464	419 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	TRIQK	Q629K1	86 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	LRTM2	Q8N967	370 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	SLC35E1	Q96K37	410 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		12.77	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	FABP1	P07148	127 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	IAPP	P10997	89 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	SLC25A6	P12236	298 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX23-208	ENST00000551098	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37

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