RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547031.5

KRT8-208, Transcript of keratin 8, human

TSL 2

Gene KRT8, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRT8-208	ENST00000547031	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	C2orf83	Q53S99	150 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	IL22RA2	Q969J5	263 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	RARRES2	Q99969	163 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	FABP12	A6NFH5	140 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	NXPH3	O95157	252 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	CRYBB3	P26998	211 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	P2RY1	P47900	373 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	RND2	P52198	227 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	LEMD1	Q68G75	181 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	STH	Q8IWL8	128 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031		Q8WTZ3	238 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	IGKV1-17	P01599	117 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	ANXA3	P12429	323 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	AKR1C4	P17516	323 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	NPY1R	P25929	384 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	OR10J1	P30954	320 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	TMEM187	Q14656	261 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	OR11H2	Q8NH07	326 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	MCFD2	Q8NI22	146 aa		12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031		H3BMQ9	156 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	IFNA10	P01566	189 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	TNFSF8	P32971	234 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	PRR13	Q9NZ81	148 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	HELT	A6NFD8	242 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	CCR6	P51684	374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	SRPX	P78539	464 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	SMCO1	Q147U7	214 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	LGI3	Q8N145	548 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	AGRN	O00468	2067 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031		A0A0B4J2A0	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031		K7EQG2	157 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	AP3S2	P59780	193 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	NPIPB3	Q92617	1050 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031		U3KQ87	197 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	CCDC160	A6NGH7	325 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	IFNA4	P05014	189 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	IL4	P05112	153 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	DHRS2	Q13268	280 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	MFF	Q9GZY8	342 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	RBKS	Q9H477	322 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KRT8-208	ENST00000547031	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	DEDD	O75618	318 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	RD3L	P0DJH9	198 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	FBXL17	Q9UF56	701 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031		U3KQE9	123 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	TOMM40	O96008	361 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	SPP1	P10451	314 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	S100A5	P33763	92 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KRT8-208	ENST00000547031	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5

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