RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545678.1

RBM7-208, Transcript of RNA binding motif protein 7, human

TSL 3 BASIC

Gene RBM7, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM7-208	ENST00000545678	SERPINA2	P20848	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SPRR2E	P22531	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SLC2A5	P22732	501 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SPRR2B	P35325	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SPRR2A	P35326	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	UBE2D1	P51668	147 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	DOK5	Q9P104	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678		A0A0B4J293	547 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	MFAP4	P55083	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	CXCR4	P61073	352 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	CCR6	P51684	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	TPBG	Q13641	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	GPR176	Q14439	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	STPG4	Q8N801	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	MOB3A	Q96BX8	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM7-208	ENST00000545678	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	GNG7	O60262	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	ZBTB25	P24278	435 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678		A0A1W2PPK0	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678		H0Y9J4	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	FCGR3B	O75015	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	PSMB3	P49720	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	PPT1	P50897	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	PSME3	P61289	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	COQ8A	Q8NI60	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	CYB5B	O43169	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	RMI2	Q96E14	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	GPER1	Q99527	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	SLA	Q13239	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RBM7-208	ENST00000545678	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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