RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 IGKV3-15P01624 115 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 LINC00614P0C842 121 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 LINC00173Q6ZV60 143 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 VWC2LB2RUY7 222 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 H0Y8G0 127 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C20orf202A1L168 122 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 MGST3O14880 152 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TSPOP30536 169 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OSTCQ9NRP0 149 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 ABCA4P78363 2273 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 M0R2Z0 102 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 ISLRO14498 428 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 HSBP1O75506 76 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 C19orf35Q6ZS72 473 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 ITLN1Q8WWA0 313 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 SRRM5B3KS81 715 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 REG1AP05451 166 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 IGLL1P15814 213 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 STUMQ69YW2 141 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 WDR73Q6P4I2 378 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TCF24Q7RTU0 167 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 FAM216BQ8N7L0 139 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 NUP35Q8NFH5 326 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 BLNKQ8WV28 456 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 CCL13Q99616 98 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 ASCL2Q99929 193 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 TMEM167BQ9NRX6 74 aa11.52□□□□□ -0.56
PRAME-214ENST00000543184 PPOXP50336 477 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 NUDT11Q96G61 164 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 UQCRFS1P47985 274 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 KLRB1Q12918 225 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SLC25A33Q9BSK2 321 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 RNF24Q9Y225 148 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 TOX4O94842 621 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ZNF137PP52743 207 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ZNF138P52744 262 aa11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 J3QW42 95 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 M0R1B8 84 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 F2RL2O00254 374 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 IGHG3P01860 377 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 HLA-DQA1P01909 254 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 MT-ND6P03923 174 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CT45A6P0DMU7 189 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CT45A5P0DMU8 189 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CT45A7P0DMV0 189 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 RNF151Q2KHN1 245 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 HIGD1CA8MV81 97 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 C8orf88P0DMB2 117 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SARAFQ96BY9 339 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 OR8B2Q96RD0 313 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 TNFRSF19Q9NS68 423 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 hDV102S1A0JD36 115 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 CHODLQ9H9P2 273 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.5□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 TMEM8BA6NDV4 472 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 LEMD1Q68G75 181 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.49□□□□□ -0.57
PRAME-214ENST00000543184 UPK2O00526 184 aa11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms