RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542777.1

DDX11-222, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

TSL 2

Gene DDX11, Length 489 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-222	ENST00000542777	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	AGRN	O00468	2067 aa		11.69	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777		A0A0G2JRQ6	117 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SCGB2A1	O75556	95 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	P2RY1	P47900	373 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PRR20E	P86478	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PRR20C	P86479	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PRR20D	P86480	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PRR20B	P86481	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PRR20A	P86496	221 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777		Q8NAQ8	132 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TERB2	Q8NHR7	220 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	IGLL5	B9A064	214 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	UCP1	P25874	307 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MEF2D	Q14814	521 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	HRH4	Q9H3N8	390 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MCUB	Q9NWR8	336 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	APLN	Q9ULZ1	77 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	DISC1	C4P0D8	188 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	C11orf94	C9JXX5	98 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	PLA2G10	O15496	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	IGKV1-17	P01599	117 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF688	P0C7X2	276 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SPP1	P10451	314 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	BTC	P35070	178 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	SPCS3	P61009	180 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	IFITM3	Q01628	133 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	BSX	Q3C1V8	233 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	TRIQK	Q629K1	86 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777		Q6ZRM9	215 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	DCANP1	Q8TF63	244 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	B3GALNT1	O75752	331 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	MIF	P14174	115 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	CCR6	P51684	374 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	S100Z	Q8WXG8	99 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CDS2	O95674	445 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	C4BPB	P20851	252 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HTR2B	P41595	481 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	DHRS2	Q13268	280 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	FAM219A	Q8IW50	185 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	OR52E5	Q8NH55	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777		Q8WTZ3	238 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	GPR132	Q9UNW8	380 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777		U3KQE9	123 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HELT	A6NFD8	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	OR5AC1	P0C628	307 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	AP3S2	P59780	193 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	ZNF846	Q147U1	533 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	AARD	Q4LEZ3	155 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PRRT1	Q99946	306 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777		X6R8D5	127 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	IGLC1	P0CG04	106 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	SLC25A4	P12235	298 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	RND2	P52198	227 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DDX11-222	ENST00000542777	PSMG4	Q5JS54	123 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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